54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0532 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 450 aa  905    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  53.49 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  42.83 
 
 		 462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  45.3 
 
 		 458 aa  335  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  32.96 
 
 		 470 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  32.46 
 
 		 399 aa  146  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  30.09 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  28.3 
 
 		 499 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  29.19 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  31.59 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  35.67 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  35.74 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  28.25 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  30.06 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  29.77 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  31.95 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  33.22 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  29.87 
 
 		 389 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  28.57 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  28.99 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  28.23 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  29.5 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  31.9 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  27.53 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  27.46 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  28 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  30.03 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 		 526 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  31.8 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  26.45 
 
 		 416 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  25.4 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  36.31 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  29.17 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  29.17 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  28.77 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  29.17 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  29.17 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  27.68 
 
 		 575 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  29.55 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  28.24 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  28.81 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  27.14 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  28.41 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  28.94 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  28.62 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  25.17 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  25.17 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  25.06 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  24.89 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  24.95 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  23.84 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  24.95 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  24.26 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  25.89 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>