More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0228 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
401 aa  803    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  69.19 
 
 
401 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  64.25 
 
 
402 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  54.25 
 
 
406 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  53.27 
 
 
405 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  54 
 
 
411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  50.87 
 
 
406 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  51.38 
 
 
405 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  53.28 
 
 
405 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  51.24 
 
 
416 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  52.9 
 
 
768 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  39.51 
 
 
564 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
575 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  34.63 
 
 
1188 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
396 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  32.2 
 
 
723 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  37.57 
 
 
573 aa  180  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  33.99 
 
 
557 aa  176  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
400 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  34.64 
 
 
569 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  33.91 
 
 
601 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
403 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  29.55 
 
 
603 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
412 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
415 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  32.29 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
377 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
417 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
412 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
395 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
393 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.1 
 
 
404 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
392 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.48 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.44 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
439 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.97 
 
 
650 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
436 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.59 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
409 aa  96.3  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
475 aa  96.3  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
392 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
810 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
672 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
365 aa  94  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
377 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 
414 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  30.46 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
405 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
495 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
377 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
499 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
403 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  26.8 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
410 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.5 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.19 
 
 
442 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.27 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.15 
 
 
498 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.15 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.15 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
438 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  24.86 
 
 
383 aa  90.1  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.81 
 
 
385 aa  89.7  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
406 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
403 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
438 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
435 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
439 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
410 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
404 aa  89.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
419 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
409 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
388 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>