203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0204 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0204  siroheme synthase-like protein  100 
 
 		 260 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2674  siroheme synthase  56.75 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  38.11 
 
 		 480 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.57 
 
 		 481 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37 
 
 		 467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114628  normal  0.960594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.78 
 
 		 473 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.82 
 
 		 478 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.82 
 
 		 478 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.96 
 
 		 482 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.7 
 
 		 464 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  35.93 
 
 		 474 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  33.33 
 
 		 468 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0347  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.94 
 
 		 464 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.354994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.18 
 
 		 475 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  30.57 
 
 		 459 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.95 
 
 		 482 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.8 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32 
 
 		 480 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.03 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  33.46 
 
 		 485 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.83 
 
 		 489 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.13 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  33.58 
 
 		 464 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.96 
 
 		 462 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.57 
 
 		 478 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.83 
 
 		 484 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  31.23 
 
 		 470 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.79 
 
 		 479 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  30.19 
 
 		 459 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 480 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  33.58 
 
 		 464 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  28.3 
 
 		 459 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.97 
 
 		 479 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  28.3 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  28.3 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  28.3 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  29.43 
 
 		 457 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.86 
 
 		 528 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.46 
 
 		 462 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  29.43 
 
 		 457 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.85 
 
 		 484 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  29.43 
 
 		 457 aa  99  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  29.43 
 
 		 457 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.43 
 
 		 457 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  27.92 
 
 		 457 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  29.43 
 
 		 457 aa  99  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  29.43 
 
 		 457 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  29.43 
 
 		 457 aa  99  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4015  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.45 
 
 		 480 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.22 
 
 		 495 aa  98.6  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  28.3 
 
 		 457 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  29.06 
 
 		 457 aa  98.6  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  32.58 
 
 		 465 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.46 
 
 		 473 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  41.26 
 
 		 477 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.45 
 
 		 464 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.34 
 
 		 502 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.51 
 
 		 478 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  29.81 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  32.21 
 
 		 465 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0048  siroheme synthase  42.41 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  40.78 
 
 		 478 aa  96.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.54 
 
 		 470 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  30.11 
 
 		 473 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  30.11 
 
 		 473 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.21 
 
 		 472 aa  95.9  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  31.18 
 
 		 472 aa  95.9  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1933  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.59 
 
 		 499 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.287576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.78 
 
 		 478 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  28.52 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.72 
 
 		 507 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  29.43 
 
 		 467 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  26.42 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.26 
 
 		 472 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.07 
 
 		 478 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  30.26 
 
 		 472 aa  92.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  30.26 
 
 		 472 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.86 
 
 		 458 aa  92  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  27.44 
 
 		 314 aa  92  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  26.42 
 
 		 306 aa  92  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.57 
 
 		 463 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  27.51 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.05 
 
 		 554 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.91 
 
 		 476 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1671  siroheme synthase  32.13 
 
 		 464 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105367  normal  0.362016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.77 
 
 		 476 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  27.34 
 
 		 462 aa  89.4  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.57 
 
 		 463 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  30.24 
 
 		 225 aa  89  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  30.42 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.2 
 
 		 463 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  28.03 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3024  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.88 
 
 		 505 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4522  siroheme synthase  31.52 
 
 		 386 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1508  siroheme synthase  34.55 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.359282  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.84 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  32.95 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  38 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.84 
 
 		 473 aa  82.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.81 
 
 		 464 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>