More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4697 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.63 
 
 
215 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  90.23 
 
 
215 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  90.7 
 
 
215 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.86 
 
 
215 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  80.47 
 
 
215 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.53 
 
 
215 aa  357  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  79.53 
 
 
215 aa  357  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.07 
 
 
215 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.28 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.45 
 
 
217 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.22 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  56.22 
 
 
217 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.78 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  38.6 
 
 
391 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  35.47 
 
 
228 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  38.46 
 
 
228 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.09 
 
 
215 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  33 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 
224 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.47 
 
 
217 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  34.71 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.85 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  29.56 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  34.3 
 
 
246 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 
217 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  31.18 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  32.35 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  33.53 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.94 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  29.35 
 
 
219 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.94 
 
 
226 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  32.18 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  32.18 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  29.56 
 
 
303 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  32.18 
 
 
303 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  31.55 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  31.61 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  31.61 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  33.54 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  33.14 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  27.22 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  32.93 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  30.17 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.88 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  29.57 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  28.99 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  28.4 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.98 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  28.99 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  27.22 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  32.26 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  26.9 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  27.6 
 
 
226 aa  61.6  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  32.26 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  28.43 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  27.75 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  32.26 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  27.17 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  27.06 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  26.34 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  27.46 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  24.51 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  30.1 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  26.04 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.07 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  27.01 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  27.88 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  30.64 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.07 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.75 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  28.09 
 
 
260 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  26.63 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  30.35 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  30.35 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.17 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.04 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  26.95 
 
 
237 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  27.75 
 
 
261 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.04 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.26 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  25.88 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  26.04 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.04 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  27.49 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.01 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.29 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  27.49 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  26.04 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  25.89 
 
 
270 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>