More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3180 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3180  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 298 aa  621  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.38 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  36.28 
 
 		 333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  35.12 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  31.63 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  32.04 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 		 801 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 		 596 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3837  glycosyl transferase family 2  41.04 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3223  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0595343  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0318  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0743987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3441  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4742  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.877502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 727 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3665  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 1035 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0348  glycosyl transferase family 2  39.52 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.7 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.7 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  32.73 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.41 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.78 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.63 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.09 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 		 1032 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.04 
 
 		 251 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1419  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.23 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.67 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 518 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.24 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  31.01 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 573 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.31 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6302  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  25 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0524  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.38 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  33.88 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  33.88 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 1250 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  33.88 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  27.15 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.94 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  33.1 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>