28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2702 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  68.08 
 
 		 355 aa  502  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  68.08 
 
 		 355 aa  502  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  36.01 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  33.52 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  33.15 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  33.15 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  30.08 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  29.78 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  29.49 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  29.49 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  28.01 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  29.41 
 
 		 249 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  28.84 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  32.05 
 
 		 386 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  28.57 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  27.04 
 
 		 378 aa  85.9  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  29.12 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  27.54 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  27.81 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  25.45 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  25.45 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  25.45 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  27.09 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  27.55 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  29.17 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  27.5 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  23.9 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>