More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1310 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1310  hypothetical protein  100 
 
 
801 aa  1644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1099  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.15 
 
 
858 aa  773    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00716839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1208  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  49.63 
 
 
849 aa  799    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757015  hitchhiker  0.0025212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  48.52 
 
 
840 aa  779    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2884  glutamyl peptidase  83.48 
 
 
801 aa  1370    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.880612  decreased coverage  0.00000000837764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2966  glutamyl peptidase  82.73 
 
 
801 aa  1357    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.345209  hitchhiker  0.000634709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3062  glutamyl peptidase  82.6 
 
 
802 aa  1361    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.310583  hitchhiker  0.000145911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0846  hypothetical protein  43.3 
 
 
841 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.826498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.43 
 
 
829 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.293087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.85 
 
 
840 aa  515  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.32 
 
 
815 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.497099  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_249  predicted protein  35.25 
 
 
835 aa  432  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0915  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.11 
 
 
920 aa  425  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  32.77 
 
 
865 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.37 
 
 
833 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.92 
 
 
820 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05496  hypothetical protein  52.34 
 
 
181 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
660 aa  84.3  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.92 
 
 
688 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.81 
 
 
864 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.78 
 
 
692 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.61 
 
 
708 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 
692 aa  77  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.74 
 
 
686 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.11 
 
 
680 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.62 
 
 
689 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.16 
 
 
677 aa  75.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.18 
 
 
594 aa  75.5  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  29.5 
 
 
691 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.29 
 
 
838 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
631 aa  73.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.21 
 
 
691 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.78 
 
 
634 aa  73.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.45 
 
 
697 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.78 
 
 
931 aa  72  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.67 
 
 
656 aa  71.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
680 aa  70.5  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.05 
 
 
661 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.55 
 
 
667 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.28 
 
 
868 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.37 
 
 
882 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.68 
 
 
571 aa  68.9  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.27 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  25.6 
 
 
693 aa  67.8  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.75 
 
 
716 aa  67.4  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.44 
 
 
617 aa  67.8  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.2 
 
 
938 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0410  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  31.65 
 
 
712 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0851483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2548  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.16 
 
 
644 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152955  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.4 
 
 
695 aa  66.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.81 
 
 
575 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.03 
 
 
720 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.39 
 
 
642 aa  65.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 
938 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.65 
 
 
619 aa  65.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  29.73 
 
 
688 aa  65.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 
957 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.17 
 
 
822 aa  65.1  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.7 
 
 
605 aa  64.7  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.26 
 
 
1001 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.78 
 
 
938 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.91 
 
 
942 aa  64.7  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.07 
 
 
588 aa  64.7  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  25.96 
 
 
649 aa  64.7  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.78 
 
 
944 aa  64.3  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  27.98 
 
 
529 aa  64.3  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  23.48 
 
 
867 aa  64.3  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.78 
 
 
944 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.63 
 
 
726 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.78 
 
 
944 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.21 
 
 
667 aa  63.9  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.78 
 
 
944 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.93 
 
 
653 aa  63.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4095  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.19 
 
 
620 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.26 
 
 
847 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.89 
 
 
674 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  27.64 
 
 
656 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0382  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.79 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0110228  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.33 
 
 
735 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.53 
 
 
982 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.18 
 
 
572 aa  63.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.393632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.11 
 
 
665 aa  62.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.89 
 
 
674 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.53 
 
 
845 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
607 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.25 
 
 
673 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  27.24 
 
 
656 aa  62.4  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.22 
 
 
664 aa  62.4  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.57 
 
 
643 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.77 
 
 
943 aa  62  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  25.36 
 
 
643 aa  62  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.57 
 
 
652 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.67 
 
 
644 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.07 
 
 
822 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.92 
 
 
607 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 
652 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 
652 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.85 
 
 
692 aa  62  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.29 
 
 
824 aa  62  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.48 
 
 
588 aa  61.6  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>