More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2195 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2195  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase, putative  100 
 
 		 447 aa  920    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  45.54 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0806  glutathione reductase  40.77 
 
 		 443 aa  352  7e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1191  glutathione reductase  40.09 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1411  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.03 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0040  glutathione reductase  30.89 
 
 		 443 aa  244  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  30.07 
 
 		 443 aa  232  8.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  29.63 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  28.67 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  31.08 
 
 		 455 aa  216  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  31.22 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  31.22 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  29.8 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  31 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  30.8 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  30.8 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  30.77 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.21 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  25.78 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 		 459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  30.02 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 		 470 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.2 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.29 
 
 		 452 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.17 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.92 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.3 
 
 		 459 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.78 
 
 		 463 aa  193  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.98 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  28.17 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.17 
 
 		 459 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  26.68 
 
 		 452 aa  189  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  25.22 
 
 		 448 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.21 
 
 		 470 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.47 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.36 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.67 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.85 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  29 
 
 		 459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.86 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  27.68 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.06 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  27.8 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  28.41 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.89 
 
 		 466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  27.77 
 
 		 449 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.96 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  27.42 
 
 		 451 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  27.38 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.86 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  28.13 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.54 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.39 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  28.01 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  28.01 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  28.01 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  28.01 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  28.01 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  28.01 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.03 
 
 		 448 aa  179  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 		 467 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.38 
 
 		 467 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  28.01 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  27.79 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  27.37 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  27.8 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.96 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.96 
 
 		 467 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.72 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.28 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.88 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  27.75 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.98 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2396  glutathione-disulfide reductase  27.59 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  28.25 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.39 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.07 
 
 		 468 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0328  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.03 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  27.74 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  27.37 
 
 		 458 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  27.81 
 
 		 459 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.76 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  27.87 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>