More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0752 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0752  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00453493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1246  hypothetical protein  65.02 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000369455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1271  hypothetical protein  65.02 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000727761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.57 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  36.19 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  36.19 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.19 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  35.82 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  35.82 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  35.82 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  37.96 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  35.21 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  34.94 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  34.94 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  36.69 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  33.96 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  34.48 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  29.6 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  30.71 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  32.36 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  32.37 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  32.67 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  30.08 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  30.08 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.08 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  30.99 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  33.75 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  29 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  33.08 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  31.82 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  29.88 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  29.72 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  29.89 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  28.05 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  28.25 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  31.87 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  27.27 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  29 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  27.27 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  29.06 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  28.63 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  28.06 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  31.56 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  26.72 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  27.98 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  27.61 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  27.57 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  29.17 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  27.62 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  27.16 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  30.26 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  26.54 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  27.13 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  26.16 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2085  protein of unknown function DUF152  26.95 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000113005  decreased coverage  0.0000000000000053007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  28.51 
 
 		 246 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  26.36 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  27.92 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  25.48 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  27.27 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  26.86 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  28.74 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09450  hypothetical protein  25.48 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000208595  normal  0.0474468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  25 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  31.6 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.51 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  28.03 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  28.03 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  28.03 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  26.72 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1643  hypothetical protein  29.48 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  24.9 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  27.08 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  27.08 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  27.69 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  25.1 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  26.89 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  26.98 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  27.08 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2437  protein of unknown function DUF152  32.24 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000259762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  28.25 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  28.42 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  25.51 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  29.71 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  23.55 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  29.71 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  26.19 
 
 		 241 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  28.63 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  26.09 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0490  protein of unknown function DUF152  25.41 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000444061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  28.4 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  25.3 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  25.88 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0621  protein of unknown function DUF152  28.46 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  28.05 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2806  hypothetical protein  23.7 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  hitchhiker  0.00000205022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>