More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0044 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 98 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  88.78 
 
 		 98 aa  182  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  88.78 
 
 		 98 aa  182  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  60.42 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  60.42 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 		 96 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  59.38 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  58.33 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  54.74 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  53.12 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  55.32 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  52.08 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  48.94 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  45.92 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  47.92 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  40 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  40.62 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  43.75 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  41.24 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  37.63 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  36.56 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  39.58 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  32.26 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  32.35 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  34.41 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>