41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0788 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0788  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  310  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.449202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0964  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 281 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  54.1 
 
 		 275 aa  70.5  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  54 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1396  hypothetical protein  35.4 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  43.66 
 
 		 287 aa  67.4  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  61.54 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  45 
 
 		 317 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  55.77 
 
 		 306 aa  64.7  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  61.11 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  36.08 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  61.11 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  36.96 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  58.33 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  58.33 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  58.33 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  50 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  48.98 
 
 		 286 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3184  hypothetical protein  36.67 
 
 		 261 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  36.46 
 
 		 286 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  36.27 
 
 		 287 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  39.34 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  55.56 
 
 		 298 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  52.78 
 
 		 290 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  37.25 
 
 		 285 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  42.37 
 
 		 315 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  46.3 
 
 		 292 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  52.78 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  31.18 
 
 		 359 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  46 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  38.6 
 
 		 278 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  37.97 
 
 		 306 aa  48.5  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  52.78 
 
 		 282 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  50 
 
 		 284 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 293 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  39.62 
 
 		 336 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  39.62 
 
 		 305 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  41.51 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2743  hypothetical protein  27.41 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  41.86 
 
 		 292 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  29.29 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>