55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0004 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  85.02 
 
 		 285 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0964  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3184  hypothetical protein  34.57 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  52.08 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  42.47 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  43.55 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  36.62 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  49.15 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  36.62 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  36.62 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  47.92 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  54.17 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2743  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  43.4 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  46.55 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  46.55 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  48 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  48.15 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  46.94 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  44 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  38.27 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  34.94 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  46.48 
 
 		 615 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  45.1 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  39.71 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  40.68 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  45.65 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0788  hypothetical protein  36.27 
 
 		 160 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.449202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  38.64 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  41.67 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  51.28 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  22.73 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  46.81 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  43.4 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 593 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  37.66 
 
 		 160 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 620 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  46.34 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  48.84 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  32.5 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  42.47 
 
 		 87 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1396  hypothetical protein  31.86 
 
 		 164 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  41.51 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  37.84 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  39.71 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  30.67 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 482 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  37.7 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  39.58 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 464 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 351 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  38.98 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>