More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3478 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3747  putative dipeptidase  99.74 
 
 
392 aa  800    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.93962  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3478  peptidase M24  100 
 
 
392 aa  802    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0525  peptidase M24  30.32 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  29.09 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  29.3 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  29.3 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  28.37 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  30.61 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2421  peptidase M24  28.83 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549884  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5045  peptidase M24  29.69 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  24.16 
 
 
437 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  30.38 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  25.37 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  30.27 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  30.8 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  29.21 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  25.91 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.41 
 
 
365 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.41 
 
 
365 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.41 
 
 
365 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4752  aminopeptidase, putative  26.25 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00197611  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.83 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.41 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.41 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.41 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  30.61 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0666  peptidase M24  25.8 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  30.61 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  26.47 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.41 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  27.92 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1797  peptidase M24  23.99 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.984988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  24.63 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.41 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  28.63 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  26.52 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  27.22 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  32.43 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  28.98 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1058  peptidase M24  26.64 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.08 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2420  peptidase M24  26.74 
 
 
422 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903637  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  26.62 
 
 
395 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  28.08 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.96 
 
 
357 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  26.77 
 
 
449 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  27.62 
 
 
357 aa  63.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  28.85 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  28.57 
 
 
359 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  25.93 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.41 
 
 
365 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  26.01 
 
 
368 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.56 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  26.17 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  26.87 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  23.47 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  29.24 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  26.59 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  25.37 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0354  peptidase M24  24.71 
 
 
419 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1559  peptidase M24  27.76 
 
 
436 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  28.06 
 
 
353 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  26.02 
 
 
415 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  23.19 
 
 
359 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  34.06 
 
 
348 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  26.92 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  28.84 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  27.05 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  23.73 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3765  peptidase M24  26.05 
 
 
422 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2365  peptidase M24  28.51 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3838  peptidase M24  26.05 
 
 
422 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  25.75 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3777  peptidase M24  26.05 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.312064  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  25.75 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1890  proline dipeptidase  25.28 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  29.58 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  23.98 
 
 
356 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  25.6 
 
 
253 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  24.22 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  23.98 
 
 
356 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  25.28 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  24.82 
 
 
361 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.46 
 
 
347 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  23.98 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  21.67 
 
 
397 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  23.39 
 
 
356 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  29.33 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  27.44 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  24.87 
 
 
364 aa  57  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.49 
 
 
356 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  22.3 
 
 
398 aa  56.6  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  23.98 
 
 
356 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  27.65 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  23.98 
 
 
356 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  26.43 
 
 
397 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  30 
 
 
276 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.41 
 
 
364 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  27.73 
 
 
429 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>