82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1221 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
326 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  98.16 
 
 
326 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  81.9 
 
 
326 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  47.16 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 
316 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  45.33 
 
 
309 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  44.97 
 
 
296 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 
305 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
326 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
326 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
302 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
309 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
328 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
310 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  34.75 
 
 
323 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  30.1 
 
 
338 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  32.79 
 
 
642 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
308 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.91 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.71 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  25.71 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.42 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  27.63 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.42 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
528 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  24.25 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
313 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
310 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  27.17 
 
 
1041 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
338 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 
460 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  25.32 
 
 
1065 aa  49.3  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
623 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2946  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.765894  normal  0.180956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.48 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  23.21 
 
 
281 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.48 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
748 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4197  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
753 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.41 
 
 
1132 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  29.6 
 
 
754 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.9 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
310 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.9 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  33.66 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
348 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
355 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>