More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3606 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3606  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  690    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813853  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1731  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.69 
 
 
325 aa  252  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2878  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.06 
 
 
329 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.37 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0918  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.28 
 
 
328 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45 
 
 
335 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.26 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.589505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1465  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.06 
 
 
327 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0983  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.25 
 
 
332 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7042  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.42 
 
 
321 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0827944  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46210  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.82 
 
 
326 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2744  ribose-phosphate pyrophosphokinase family protein  42.35 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11994  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3009  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.35 
 
 
319 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.4 
 
 
340 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.49 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.38 
 
 
317 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.56 
 
 
329 aa  143  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.85 
 
 
316 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.26 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  30.19 
 
 
326 aa  135  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.84 
 
 
324 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.25 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000509786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.65 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.03 
 
 
339 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.15 
 
 
312 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.05 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.27 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.67 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.31 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.79 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.68 
 
 
326 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.21 
 
 
308 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.4 
 
 
326 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.83 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.08 
 
 
326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.78 
 
 
326 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.89 
 
 
318 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.07 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.95 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.21 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.46 
 
 
339 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  31.46 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.45 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1425  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.41 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000869959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.46 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.6 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.05 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.91 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.43 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
315 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4123  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.41 
 
 
310 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0241029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.79 
 
 
326 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.15 
 
 
340 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34307  Ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.66 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362239  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.28 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0183  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.21 
 
 
331 aa  126  5e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.16 
 
 
327 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.84 
 
 
323 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.13 
 
 
313 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.62 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.55 
 
 
312 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.88 
 
 
315 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  30.28 
 
 
312 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.16 
 
 
325 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.21 
 
 
327 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.91 
 
 
334 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.71 
 
 
314 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.773652  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.78 
 
 
318 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.55 
 
 
312 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0609  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.12 
 
 
324 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.78 
 
 
318 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.39 
 
 
322 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.45 
 
 
310 aa  123  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.84 
 
 
317 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.51 
 
 
311 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00330  conserved hypothetical protein  29.45 
 
 
357 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65580  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.51 
 
 
320 aa  122  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0342194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.37 
 
 
361 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.79 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.6 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.06 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.75 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.99 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.97 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.21 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  29.5 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.53 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.11 
 
 
359 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>