More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00330 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH00330  conserved hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  729    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01965  phosphoribosyl diphosphate synthase isoform 4 (AFU_orthologue; AFUA_4G10790)  55.49 
 
 
320 aa  365  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65580  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.3 
 
 
320 aa  340  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0342194  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34307  Ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.14 
 
 
323 aa  332  6e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362239  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02440  ribose-phosphate diphosphokinase, putative  51.16 
 
 
328 aa  328  8e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.89 
 
 
315 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.17 
 
 
317 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.18 
 
 
315 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66107  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.54 
 
 
417 aa  278  9e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.19 
 
 
310 aa  278  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.89 
 
 
317 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.9 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.9 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.25 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.12 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.97 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.97 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.97 
 
 
346 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.52 
 
 
314 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.21 
 
 
319 aa  272  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.64 
 
 
311 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.02 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.21 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.32 
 
 
317 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42 
 
 
325 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.66 
 
 
319 aa  269  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.59 
 
 
317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.8 
 
 
316 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.35 
 
 
314 aa  268  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.6 
 
 
317 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.66 
 
 
319 aa  268  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.09 
 
 
329 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.21 
 
 
314 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.35 
 
 
314 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.33 
 
 
314 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.59 
 
 
317 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.91 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.91 
 
 
316 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.49 
 
 
332 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.19 
 
 
322 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.02 
 
 
317 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.57 
 
 
324 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.17 
 
 
317 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.78 
 
 
327 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.78 
 
 
316 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.53 
 
 
314 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  40.8 
 
 
321 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.88 
 
 
327 aa  262  6e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.88 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.8 
 
 
317 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.9 
 
 
317 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.37 
 
 
325 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.79 
 
 
319 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.28 
 
 
312 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  43.23 
 
 
317 aa  260  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.31 
 
 
314 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.97 
 
 
324 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.17 
 
 
315 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.88 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.35 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.73 
 
 
313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.35 
 
 
320 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.35 
 
 
320 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.73 
 
 
313 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.44 
 
 
313 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.44 
 
 
313 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.49 
 
 
314 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.44 
 
 
313 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.35 
 
 
318 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.73 
 
 
310 aa  258  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  41.28 
 
 
321 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.44 
 
 
310 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.44 
 
 
313 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.28 
 
 
321 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.44 
 
 
310 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.44 
 
 
310 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.15 
 
 
310 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.75 
 
 
316 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.38 
 
 
338 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.19 
 
 
311 aa  256  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.29 
 
 
324 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.77 
 
 
320 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.77 
 
 
320 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  41.79 
 
 
312 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.86 
 
 
310 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.77 
 
 
318 aa  255  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.06 
 
 
318 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.06 
 
 
318 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.06 
 
 
318 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.07 
 
 
316 aa  255  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.7 
 
 
321 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>