181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2254 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  77.54 
 
 		 148 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  76.81 
 
 		 148 aa  219  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  57.78 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  57.78 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  55.64 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  55.07 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  52.59 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  54.07 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  54.35 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  54.35 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  54.35 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  54.35 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  54.35 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  54.35 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  54.35 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  54.35 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  56.3 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  55.22 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  53.62 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  55.15 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  50.72 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  50.72 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  52.99 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  50.75 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  47.83 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  47.83 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  51.22 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  54.89 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  47.1 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  39.37 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  51.22 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  48.51 
 
 		 194 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  47.83 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  47.41 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  46.72 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  51.82 
 
 		 612 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  43.07 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  53.38 
 
 		 180 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  47.41 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  50 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  47.01 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  50.72 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  45.83 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  47.01 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  50 
 
 		 193 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 193 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  45.93 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  45.93 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  48.18 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  50.36 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  45.19 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  43.41 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  47.79 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  44.03 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  51.45 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  49.62 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  36.43 
 
 		 144 aa  103  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  42.75 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  43.7 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  44.72 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  43.7 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  44.7 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  39.57 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  44.36 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  38.97 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  36.03 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  46.4 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  47.52 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  39.26 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  35.97 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  40.15 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  41.41 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  34.88 
 
 		 154 aa  94.4  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  34.07 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  40 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  43.61 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  35.66 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  40.44 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  47.33 
 
 		 171 aa  93.2  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  37.7 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  42.75 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  39.53 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>