36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0663 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  80.95 
 
 		 176 aa  250  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  80.95 
 
 		 176 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  52.32 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  50.9 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  51.75 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  51.23 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  29.71 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.85 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  26.58 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  28.74 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  28.74 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  28.95 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  28.21 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  27.27 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  27.44 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  26.4 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  26.06 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  28.12 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  28.12 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  28.48 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  26.8 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  30.43 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  28.47 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  31.29 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  26.49 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  28.21 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  24.84 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  28.38 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  27.59 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  29.87 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  29.73 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  25.5 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  26.32 
 
 		 171 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  30.52 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>