45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3540 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  287  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  51.08 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  48.95 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  50.36 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  45.16 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  40.14 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  43.09 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  41.86 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3604  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  37.1 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  28.93 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  35.48 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  34.03 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  32.09 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  33.87 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  26.19 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  32.76 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  30.53 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  33.7 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  41.25 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  39.76 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  43.02 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  29.69 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  32.73 
 
 		 151 aa  47.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  29.06 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  24.11 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  31.09 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  34.43 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  27.07 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  32.79 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  31.2 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  28.69 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  30.82 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  30.91 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  25.78 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  22.58 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  33.72 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>