270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2825 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  57.04 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  56.62 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  57.04 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  57.04 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  59.12 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  58.39 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  55.56 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  58.39 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  55.56 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  55.22 
 
 		 135 aa  156  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  55.56 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  50.74 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  55.15 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  52.94 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  52.94 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  52.94 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  54.41 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  46.27 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  48.91 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  49.64 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  49.64 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  46.62 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  52.21 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  47.06 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  48.18 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  53.08 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  44.53 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  45.93 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  45.26 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  41.91 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  45.26 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  45.26 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  44.12 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.58 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.03 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.6 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.77 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  43.09 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.27 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  39.73 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  43.41 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.22 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.24 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  41.78 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  37.32 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.88 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  37.32 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.88 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.73 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  37.32 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  37.32 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  37.32 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  37.32 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  37.32 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  41.6 
 
 		 135 aa  93.2  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  32.12 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  40.62 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  34.62 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  41.6 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  41.6 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.04 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.41 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  34.62 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  34.62 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  37.1 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  35.92 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.28 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.84 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.17 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.4 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.69 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  38.76 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0692  flagellar basal body rod protein FlgC  34.84 
 
 		 167 aa  89.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.28 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>