More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1997 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  100 
 
 
297 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.21 
 
 
300 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.48 
 
 
301 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.48 
 
 
301 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  42.75 
 
 
300 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.61 
 
 
288 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.42 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.39 
 
 
302 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.3 
 
 
292 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  39.64 
 
 
314 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.87 
 
 
333 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.3 
 
 
322 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.13 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.39 
 
 
336 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  36.43 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.92 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  41.33 
 
 
315 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  41.33 
 
 
315 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  41.33 
 
 
292 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  41.33 
 
 
412 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  41.33 
 
 
315 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  41.33 
 
 
315 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.93 
 
 
290 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.68 
 
 
297 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  34.92 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  35.43 
 
 
286 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.13 
 
 
319 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.28 
 
 
278 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  39.81 
 
 
406 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.52 
 
 
316 aa  132  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.76 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  34.05 
 
 
274 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  31.4 
 
 
309 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.91 
 
 
311 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.12 
 
 
277 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  42.57 
 
 
310 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  29.64 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1411  Esterase/lipase  34.39 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.667449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  30.22 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.35 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  30.28 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  29.24 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.04 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.67 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.67 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  33.96 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.53 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  32.18 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  39.52 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  39.52 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  24.16 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  31.65 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.39 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  29.61 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.15 
 
 
407 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.19 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2198  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.2 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.38 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.53 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  29.92 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  29.32 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  29.32 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  33.54 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  28.81 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  30 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.67 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.89 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  29.92 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  36.05 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  30.18 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.08 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  27.8 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  28.16 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  27.75 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  29.02 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  27.35 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.9 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  27.35 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.1 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  26.4 
 
 
593 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  28.06 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  33.85 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  24.91 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1833  esterase-like protein  25.66 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  26.21 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3439  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.9 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  26.19 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  30.81 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  27.83 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  29.38 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  29.28 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  29.28 
 
 
391 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  32.31 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  29.67 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  34.35 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>