More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0602 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  57.4 
 
 		 239 aa  268  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  56.05 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  53.48 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  55.56 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  54.87 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  53.51 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  52.23 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  53.1 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  54.22 
 
 		 240 aa  243  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  53.98 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  53.98 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  52.68 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  53.33 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  53.33 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  52.17 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  52.65 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  51.8 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  48.9 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.9 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  52.25 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  51.11 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.65 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  52.68 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  48.95 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  48.5 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  47.64 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  49.55 
 
 		 243 aa  221  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  48.07 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  49.56 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  48.87 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  45.3 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  47.73 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  45.78 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  50.22 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  47.35 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  47.83 
 
 		 236 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  48.21 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  46.19 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  49.54 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  47.32 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  47.75 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  47.75 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  48.2 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  45.61 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  45.45 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  45.67 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  46.98 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  45.66 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  45.66 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  42.13 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  43.84 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  46.15 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  44.98 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.23 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  46.61 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  46.15 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  43.84 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  43.61 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  46.41 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  42.58 
 
 		 215 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  42.31 
 
 		 216 aa  178  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  43.38 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  42.08 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  41.7 
 
 		 227 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  41.67 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  40.27 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  43.87 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  43.66 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.31 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  39.07 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  39.27 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  39.27 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  39.27 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  40.65 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  39.27 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  39.74 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  40.91 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  38.36 
 
 		 243 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  38.81 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  38.81 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  38.81 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  38.81 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  38.81 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  39.61 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  38.81 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  41.26 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  38.81 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  37.9 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  38.36 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  38.36 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  38.36 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  39.39 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>