25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_5022 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  99.12 
 
 		 341 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  100 
 
 		 341 aa  670    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  65.85 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  60.14 
 
 		 340 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  56.31 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  56.31 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.59 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  29.8 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.68 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.02 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.02 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.75 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  25.32 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  27.67 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  27.34 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  33.33 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  26.03 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3504  Allergen V5/Tpx-1 family protein  24.07 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0613  SCP-like extracellular  23.08 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170655  normal  0.096585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  24.18 
 
 		 466 aa  46.6  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  23.91 
 
 		 456 aa  46.6  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  29.41 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  22.55 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4541  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.63 
 
 		 150 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>