More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3812 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.84 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.84 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.84 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.84 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.84 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.07 
 
 		 302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  50.41 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.54 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  45.58 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  45.52 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  45.77 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  45.77 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  45.52 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  45.26 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  46.88 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  49.01 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  49.38 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  41.26 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  48.53 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  44.65 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  44.49 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 		 290 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  47.08 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.08 
 
 		 838 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 841 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  27.24 
 
 		 1225 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.53 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 1739 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 822 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 528 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 841 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2531  putative glycosyltransferase  32.68 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 		 378 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  26.92 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 573 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  32.63 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3864  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4915  family 2 glycosyl transferase  23.45 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 672 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.9 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  26.02 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  26.41 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 836 aa  62.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  31.69 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  21.53 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>