157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2765 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  87.69 
 
 		 740 aa  1327    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  57.79 
 
 		 770 aa  871    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  56.42 
 
 		 790 aa  868    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  100 
 
 		 738 aa  1501    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  98.64 
 
 		 738 aa  1481    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.83 
 
 		 764 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.86 
 
 		 763 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  33.03 
 
 		 763 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.57 
 
 		 763 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  31.38 
 
 		 758 aa  352  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.74 
 
 		 764 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.74 
 
 		 764 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  31.48 
 
 		 758 aa  348  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  31.48 
 
 		 758 aa  348  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  31.48 
 
 		 758 aa  348  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  31.48 
 
 		 758 aa  348  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  31.48 
 
 		 758 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  31.79 
 
 		 758 aa  347  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  31.79 
 
 		 758 aa  347  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.37 
 
 		 763 aa  346  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  32.92 
 
 		 883 aa  323  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.04 
 
 		 851 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.1 
 
 		 806 aa  301  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.1 
 
 		 708 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.08 
 
 		 719 aa  274  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.66 
 
 		 746 aa  263  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.31 
 
 		 744 aa  260  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.88 
 
 		 746 aa  241  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.93 
 
 		 746 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2243  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.77 
 
 		 768 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  hitchhiker  0.00000657541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.52 
 
 		 740 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1362  hypothetical protein  28.55 
 
 		 720 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.69 
 
 		 730 aa  155  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  23.34 
 
 		 721 aa  137  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  24.69 
 
 		 721 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  23.23 
 
 		 720 aa  127  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  23.23 
 
 		 717 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  23.23 
 
 		 717 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  23.23 
 
 		 720 aa  127  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  23.23 
 
 		 720 aa  127  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  23.67 
 
 		 720 aa  127  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  23.23 
 
 		 720 aa  127  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  23.02 
 
 		 731 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  23.06 
 
 		 720 aa  126  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24.93 
 
 		 717 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  23.67 
 
 		 720 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  23.51 
 
 		 711 aa  125  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  23.76 
 
 		 712 aa  124  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  23.76 
 
 		 712 aa  124  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  24.44 
 
 		 717 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  23.76 
 
 		 712 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  22.24 
 
 		 733 aa  120  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  23.74 
 
 		 717 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  23.63 
 
 		 717 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  23.63 
 
 		 717 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  23.63 
 
 		 717 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  23.05 
 
 		 711 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  23.48 
 
 		 717 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  23.81 
 
 		 720 aa  116  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  26.08 
 
 		 733 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.95 
 
 		 724 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.53 
 
 		 727 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  25.49 
 
 		 733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  24.11 
 
 		 711 aa  113  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  23 
 
 		 695 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  23 
 
 		 695 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23 
 
 		 695 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  26.75 
 
 		 737 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23 
 
 		 695 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  23 
 
 		 695 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.88 
 
 		 695 aa  110  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  25.65 
 
 		 733 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  23.34 
 
 		 725 aa  108  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  31.45 
 
 		 700 aa  107  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.86 
 
 		 727 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.79 
 
 		 725 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.86 
 
 		 727 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  22.77 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  25.47 
 
 		 732 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  22.77 
 
 		 700 aa  106  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.86 
 
 		 727 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.77 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  25.31 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.77 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  22.77 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.77 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.77 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.77 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.8 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  22.75 
 
 		 696 aa  104  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  23.41 
 
 		 732 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0470  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.9 
 
 		 722 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.393999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.01 
 
 		 720 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  26.01 
 
 		 734 aa  98.2  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.7 
 
 		 727 aa  94.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.7 
 
 		 727 aa  94  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.69 
 
 		 706 aa  89  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.55 
 
 		 756 aa  87.4  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.46 
 
 		 706 aa  85.5  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  21.14 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>