49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2003 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  97.31 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  34.34 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  28.4 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  26.98 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  32.14 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  25.97 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  32.41 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  24.7 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  38.83 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  26.34 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  26.2 
 
 		 759 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  22.49 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  26.32 
 
 		 703 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  26.94 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4193  glycosyl transferase family 25  27.23 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4166  glycosyl transferase family 25  27.23 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  34.62 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  40.91 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 593 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1040  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 		 1122 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  22.6 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  25.2 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.93 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>