More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4176 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 350 aa  700    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  88 
 
 		 350 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  88 
 
 		 350 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  73.24 
 
 		 355 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  54.42 
 
 		 350 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 		 350 aa  298  9e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  43.59 
 
 		 349 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 		 357 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.83 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  43.18 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2474  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.13 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3477  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.31 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2972  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.62 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679689  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3825  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  40.34 
 
 		 352 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.75 
 
 		 352 aa  225  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.14 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.07 
 
 		 347 aa  222  6e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.13 
 
 		 336 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.51 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.29 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.78 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.8 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.03 
 
 		 346 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.76 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  33.33 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.99 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.62 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.62 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 		 349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.56 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.1 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.89 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.19 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.45 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.5 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.39 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 		 347 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.97 
 
 		 368 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.91 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.16 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.16 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.16 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.16 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.86 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.16 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.16 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.16 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 336 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.86 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.85 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.08 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  30.55 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.12 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  28.44 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.34 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>