More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3112 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 315 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  85.3 
 
 		 315 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  80.51 
 
 		 315 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  69.13 
 
 		 302 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  51.13 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  50.16 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  47.48 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  49.68 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  43.67 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 341 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  42.04 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  40.67 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.53 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  41.72 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  37 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  36.34 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 351 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  36.83 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  37.5 
 
 		 356 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 323 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 321 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 434 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 434 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 390 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 287 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.24 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 290 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 297 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  29.97 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  30.45 
 
 		 494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.43 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  44.53 
 
 		 371 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  28.66 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.18 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  31.04 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>