37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2987 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  100 
 
 		 175 aa  343  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  75.68 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  76.11 
 
 		 180 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  70.39 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  65.93 
 
 		 188 aa  240  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  67.8 
 
 		 181 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  67.9 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  49.68 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  41.83 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  40.88 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  38.85 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  40.4 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  42.14 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  42.31 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  40.15 
 
 		 156 aa  97.4  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  40.15 
 
 		 156 aa  97.4  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  39.42 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  39.72 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  32.16 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  34.56 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  33.81 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  35.56 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  32.35 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  33.81 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  32.67 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  25.9 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  31.65 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  32.19 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  28.65 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  32.19 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.97 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  32.67 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  30.87 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  25.55 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  28 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  27.22 
 
 		 310 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>