37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1252 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  340  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  83.33 
 
 		 168 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  76.79 
 
 		 168 aa  265  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  81.55 
 
 		 168 aa  263  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  81.55 
 
 		 168 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  72.62 
 
 		 168 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  52.76 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  49.4 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  50.6 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  48.5 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  49.1 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  48.19 
 
 		 170 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  53.89 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  43.71 
 
 		 182 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  50.6 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  52.38 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  42.07 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  38.79 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  41.52 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  41.52 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  40.56 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  38.51 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  35.37 
 
 		 176 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  37.41 
 
 		 176 aa  97.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  35.5 
 
 		 197 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  29.61 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  32.24 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  29.92 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  30.56 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  28.91 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  36.36 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4148  protein tyrosine phosphatase-like protein  37.11 
 
 		 185 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00974385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>