More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3455 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  86.65 
 
 		 322 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  39.13 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  35.89 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  36.88 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  36.33 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  34.38 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  37.5 
 
 		 355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  34.06 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  33.02 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  34.67 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  34.67 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  34.67 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  33.75 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  33.33 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  32.28 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  34.69 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  33.33 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  33.86 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  33.02 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  36.92 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  36.81 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  35.76 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  32.53 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  31.9 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  36.97 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  34.38 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  35.05 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  35.05 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.79 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  34.98 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  35.6 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  36.97 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  33.23 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  33.13 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  33.66 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  31.53 
 
 		 628 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  31.17 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  31.35 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  33.13 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  32.62 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  32.13 
 
 		 628 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  34.86 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  32.82 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  34.98 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  33.43 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  37.11 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  29.94 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  35.21 
 
 		 642 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  37.11 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  33.82 
 
 		 640 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  36.55 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  30.27 
 
 		 644 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  36.79 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  35.42 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  32.72 
 
 		 323 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 		 655 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 644 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  33.64 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  32.62 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  33.92 
 
 		 635 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 646 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  31.8 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  34.46 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  31.8 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.38 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  33.74 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  29.79 
 
 		 647 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  30.68 
 
 		 634 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 642 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  34.76 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  30.38 
 
 		 634 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  30.56 
 
 		 634 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  34.6 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.46 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 		 633 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  30.29 
 
 		 643 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  31.46 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.52 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 		 652 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  31.75 
 
 		 645 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.06 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  33.44 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  32.52 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  31.55 
 
 		 670 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  31.45 
 
 		 645 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  29.75 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>