51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3530 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  71.43 
 
 		 236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  55.5 
 
 		 253 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  54.76 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  53.81 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  46.85 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  48.58 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  48.58 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  47.98 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  48.08 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  43.5 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  39.65 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  46.01 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  46.06 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  39.3 
 
 		 246 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  39.3 
 
 		 246 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  38.86 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  41.23 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  44.69 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  32.97 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  34.62 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  32.45 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  39.77 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  38.31 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  39.62 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  35.12 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  42.96 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  32.99 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  39.35 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  40.6 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  35.68 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  32.59 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  34.57 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1916  YhhN-like  28.07 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  35.78 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  34.48 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  28.04 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  32.7 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  36.48 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4354  YhhN family protein  30.91 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.856008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  33.85 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  30.61 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  27.89 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>