More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0661 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  819    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  75.9 
 
 		 425 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 		 413 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  54.25 
 
 		 413 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  54.39 
 
 		 405 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  54.16 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  54.16 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  54.16 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  54.16 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  53.88 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  54.16 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 405 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  54.16 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 405 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  54.16 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  54 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  54.14 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  53.25 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  36.07 
 
 		 420 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  36.8 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 427 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  31.74 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 412 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  38.63 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  35.75 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  34.44 
 
 		 493 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  33.15 
 
 		 423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 417 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  27 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.93 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  24.93 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 441 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.22 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.22 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  23.92 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 395 aa  96.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  24.38 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  24.38 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.15 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  25.22 
 
 		 443 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  23.97 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  23.97 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  23.82 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  31.3 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.1 
 
 		 430 aa  89.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  26.78 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  26.02 
 
 		 431 aa  86.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  20.29 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  20.23 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.14 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  25.82 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  24.86 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  25.61 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.52 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.35 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  25.2 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  26.64 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>