More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0997 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
434 aa  877    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.85 
 
 
429 aa  435  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.94 
 
 
427 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.36 
 
 
429 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.11 
 
 
436 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  48.11 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.18 
 
 
424 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.51 
 
 
428 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.94 
 
 
425 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.17 
 
 
424 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  49.14 
 
 
431 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.65 
 
 
430 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  47.64 
 
 
431 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.15 
 
 
425 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.94 
 
 
425 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.82 
 
 
441 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  48.91 
 
 
425 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  47.57 
 
 
422 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.31 
 
 
425 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  50.98 
 
 
431 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.78 
 
 
430 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.24 
 
 
433 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.74 
 
 
430 aa  360  2e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.59 
 
 
432 aa  361  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.63 
 
 
434 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  46.27 
 
 
427 aa  359  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  45.78 
 
 
436 aa  359  6e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.34 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  47.76 
 
 
433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.39 
 
 
439 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.53 
 
 
433 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.29 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  45.26 
 
 
423 aa  352  8.999999999999999e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  46.57 
 
 
446 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.31 
 
 
430 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  42.65 
 
 
425 aa  350  4e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  41.81 
 
 
421 aa  348  8e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  45.92 
 
 
428 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.39 
 
 
448 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.69 
 
 
429 aa  345  8e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.66 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  43.59 
 
 
426 aa  342  7e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  41.55 
 
 
426 aa  341  1e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.81 
 
 
435 aa  341  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.08 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  42.3 
 
 
425 aa  338  8e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  45.54 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  45.41 
 
 
427 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.21 
 
 
473 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  47.15 
 
 
431 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  46.72 
 
 
442 aa  335  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.12 
 
 
431 aa  332  7.000000000000001e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.84 
 
 
442 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.36 
 
 
419 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  45.36 
 
 
440 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  45.14 
 
 
440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  44.39 
 
 
425 aa  329  6e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 
425 aa  328  9e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  45.41 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.35 
 
 
497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.73 
 
 
429 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  40.28 
 
 
423 aa  327  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  47.09 
 
 
428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  43.7 
 
 
442 aa  325  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  43.44 
 
 
440 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1013  dihydroorotase  44.63 
 
 
449 aa  323  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.31 
 
 
437 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.83 
 
 
497 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.79 
 
 
438 aa  322  6e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.15 
 
 
434 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  44.15 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  43.66 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.66 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  43.66 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  43.66 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  43.66 
 
 
428 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  43.66 
 
 
428 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  44.42 
 
 
425 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  44.42 
 
 
425 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  43.41 
 
 
428 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  43.41 
 
 
428 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  43.41 
 
 
428 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 
433 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  44.42 
 
 
430 aa  317  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  43.17 
 
 
428 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  44.16 
 
 
428 aa  316  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  43.17 
 
 
428 aa  315  9e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.61 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  44.03 
 
 
431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  45.52 
 
 
426 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  46.68 
 
 
425 aa  312  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  44.61 
 
 
449 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  45.95 
 
 
425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.95 
 
 
428 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  40 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  46.72 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  44 
 
 
432 aa  309  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.91 
 
 
424 aa  309  8e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.1 
 
 
447 aa  307  3e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  44.5 
 
 
432 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>