227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0750 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 135 aa  274  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  61.4 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  58.93 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  56.3 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  58.04 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  53.78 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  55.93 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  53.72 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 114 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  49.56 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  53.64 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  49.56 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  48.72 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  50.81 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  49.56 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  51.33 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  51.33 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  48 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  52 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  53.39 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  48.67 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  48.67 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  48.67 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  50.41 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0310  aspartate alpha-decarboxylase  46.88 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  52.29 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  48.21 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  52.59 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0379  aspartate alpha-decarboxylase  47.69 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.172281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1450  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  47.37 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1769  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.25333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  48.72 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  50.89 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2220  aspartate 1-decarboxylase  52.1 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  46.15 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  48.67 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  49.52 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  45.38 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  49.07 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  51.79 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  53.57 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0408  aspartate alpha-decarboxylase  48.7 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.293009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  45.11 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  49.07 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  46.15 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  47.79 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  48.72 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  48.21 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  48.67 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0379  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0867961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  45.69 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  50.93 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  44.74 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2123  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.244541  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  47.79 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>