44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7129 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  91.78 
 
 
382 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  100 
 
 
381 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  64.29 
 
 
366 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  60.05 
 
 
384 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  41.98 
 
 
650 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  38.01 
 
 
401 aa  209  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  36.97 
 
 
379 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  42.89 
 
 
671 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  45.6 
 
 
671 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  37.08 
 
 
386 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  37.39 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  34.33 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  24.31 
 
 
427 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  29.82 
 
 
474 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  24.06 
 
 
427 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  27.95 
 
 
423 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  25 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  27.46 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  28.68 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  26.84 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  26.84 
 
 
472 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  29.97 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  28.53 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  25.46 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  21.53 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  21.35 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  22.98 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  29.05 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  23.37 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  22.1 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  27.7 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  28.33 
 
 
410 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0418  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  25.79 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00106805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02731  undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-UDPGlcNAc GlcNAc transferase  25.45 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1564  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  25.45 
 
 
352 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1262  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  29.17 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0716  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  24.16 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0692  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  23.6 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01990  predicted glycosyl transferase  26.3 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0410  Undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptidebeta- N -acetylglucosaminyltransferase  25.64 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.823553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0950  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  30.99 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3506  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  27.53 
 
 
360 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0194  glycosyltransferase family 28 protein  27.33 
 
 
340 aa  42.7  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.775118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2107  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  30.28 
 
 
364 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>