More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6808 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6808  ABC transporter related  100 
 
 
270 aa  546  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227259  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5895  ABC transporter related  91.85 
 
 
270 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3947  ABC transporter related  62.03 
 
 
295 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913784  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0158  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 
327 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1622  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.45 
 
 
319 aa  275  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0234356  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.33 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.187354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1719  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.47 
 
 
318 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0872  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.24 
 
 
320 aa  265  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0489  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.24 
 
 
320 aa  264  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0849  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.24 
 
 
320 aa  264  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0085  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.3 
 
 
324 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0627  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 
316 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0902  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 
335 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2505  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.559192  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2056  ABC transporter related  45.86 
 
 
580 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344396  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2745  ABC transporter related protein  43.82 
 
 
298 aa  225  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0918  ABC transporter related  45.31 
 
 
268 aa  222  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0896  ABC transporter related  45.31 
 
 
268 aa  221  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3008  ABC transporter related  45.66 
 
 
576 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0218  ABC transporter related  42.8 
 
 
274 aa  219  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 
324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.51 
 
 
315 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1549  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
315 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0141975  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1557  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.7 
 
 
306 aa  201  7e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000215557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0530  ABC transporter related  44.98 
 
 
274 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.841451  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34890  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.88 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0042  ABC transporter related  47.1 
 
 
267 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17720  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.13 
 
 
276 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3653  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
302 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0266  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 
333 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196095  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2741  ABC transporter related  41.98 
 
 
309 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.871465  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
540 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2072  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
348 aa  188  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0237279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1896  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 
324 aa  188  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0492  ABC transporter related  39.45 
 
 
268 aa  188  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000989  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  40.3 
 
 
310 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4401  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.26 
 
 
325 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.433175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0402  ABC transporter related  39.53 
 
 
374 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0245246  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0175  ABC transporter related  43.13 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0977018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  43.08 
 
 
552 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6688  ABC transporter related  40.3 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157267  normal  0.337888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.56 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2200  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.492449  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0446  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2392  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 
350 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.066682  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  43.08 
 
 
552 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1634  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 
334 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.666215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.85 
 
 
336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1333  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  40.17 
 
 
552 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20150  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.75 
 
 
285 aa  182  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0951838  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  41.42 
 
 
573 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  39.85 
 
 
342 aa  181  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5784  ABC transporter related  39.93 
 
 
299 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0699295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.38 
 
 
619 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
308 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2801  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
334 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0725461  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
308 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.09 
 
 
333 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.83 
 
 
327 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2173  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
376 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.98974  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
308 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 
338 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  40.8 
 
 
600 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1552  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 
324 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  40.77 
 
 
549 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  41.37 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1078  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 
339 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.102622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  36.05 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5111  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.47 
 
 
326 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1679  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.2 
 
 
347 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  41.67 
 
 
548 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1017  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
351 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  41.73 
 
 
261 aa  179  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02945  hypothetical protein  41.23 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0145  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002963  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  40.33 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  39.25 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.08 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
257 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2624  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
331 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1047  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
272 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.674446  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3967  hypothetical protein  40.07 
 
 
282 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420932  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3794  ABC transporter related  39.62 
 
 
377 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3236  ABC peptide transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 
282 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  40.15 
 
 
541 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6006  ABC transporter related  41.47 
 
 
257 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  40.89 
 
 
546 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.85 
 
 
540 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.25 
 
 
321 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3973  ABC transporter related  40.82 
 
 
282 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1846  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
450 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.231668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  40.53 
 
 
282 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>