More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0175 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0175  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0977018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06420  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  60.31 
 
 
582 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104627  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3403  ABC transporter related  58.2 
 
 
538 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01350  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.2 
 
 
286 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0042  ABC transporter related  51 
 
 
267 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2072  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.84 
 
 
348 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0237279  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34890  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.79 
 
 
289 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2724  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
353 aa  214  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.632529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.96 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  46.86 
 
 
282 aa  211  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
307 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
276 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 
282 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1679  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 
347 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 
347 aa  208  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2623  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.48 
 
 
338 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.675572  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5784  ABC transporter related  46.85 
 
 
299 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0699295 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1634  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 
334 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.666215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7460  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  47.45 
 
 
317 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
540 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  39.45 
 
 
552 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4522  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.13 
 
 
377 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00033475  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
265 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 
338 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 
539 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6688  ABC transporter related  45.67 
 
 
299 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157267  normal  0.337888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 
548 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1076  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
346 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000989  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  42.52 
 
 
310 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1660  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.42 
 
 
335 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.453104  normal  0.267068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.11 
 
 
315 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.758275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6185  ABC transporter related  49.38 
 
 
285 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0549  ABC oligopeptide/dipeptide transporter ATP-binding protein  43.21 
 
 
328 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.824636  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  45.17 
 
 
540 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  46.33 
 
 
550 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 
389 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313855  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  46.77 
 
 
553 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2741  ABC transporter related  46.09 
 
 
309 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.871465  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  45.96 
 
 
549 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  45.9 
 
 
534 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5697  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 
336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  46.51 
 
 
534 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  47.66 
 
 
552 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1484  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  0.667215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0145  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 
331 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3992  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 
360 aa  198  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.777078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  47.66 
 
 
552 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0652  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.54 
 
 
322 aa  198  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.676091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  47.24 
 
 
552 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  43.58 
 
 
575 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4852  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
261 aa  198  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.059944  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
338 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
338 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
338 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  44.05 
 
 
546 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  45.76 
 
 
370 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0502  ABC transporter related  43.39 
 
 
567 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.348202  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1274  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1896  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  42.19 
 
 
578 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0573  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  40.32 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.481261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 
338 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0411  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
368 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1901  ABC transporter related  41.25 
 
 
284 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 
691 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0562  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 
323 aa  196  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00149525 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1192  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 
324 aa  196  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.794758  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0446  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.76 
 
 
313 aa  196  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.08 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.64 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.26 
 
 
546 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  40 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2200  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.76 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.492449  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1401  ABC transporter related  48.1 
 
 
291 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06710  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.36 
 
 
295 aa  195  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0686921  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1665  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 
325 aa  195  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.76 
 
 
327 aa  195  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1732  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.2 
 
 
321 aa  195  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.561922  hitchhiker  0.00101303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1333  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.56 
 
 
343 aa  195  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
343 aa  195  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.752821  normal  0.689608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  45.14 
 
 
585 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.3 
 
 
566 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3794  ABC transporter related  46.15 
 
 
377 aa  194  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  45.76 
 
 
366 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  45.35 
 
 
556 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13040  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
333 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20150  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.86 
 
 
285 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0951838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  46.64 
 
 
276 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  45.42 
 
 
285 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0402  ABC transporter related  45.56 
 
 
374 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0245246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 
329 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>