53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6550 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  95 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  88 
 
 		 200 aa  362  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  86.5 
 
 		 200 aa  362  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  71.94 
 
 		 200 aa  298  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  69.5 
 
 		 199 aa  287  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  70.77 
 
 		 195 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  61 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  57.65 
 
 		 196 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  57.65 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  57.65 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  57.65 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  56.12 
 
 		 196 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  57.65 
 
 		 196 aa  228  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  54.08 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  54.01 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  50.53 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  50.78 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  48.94 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  48.72 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  44.51 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  46.07 
 
 		 183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  40.33 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  41.53 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  39.34 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  40.22 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  40.56 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  37.57 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  40.22 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  38.5 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  37.36 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  37.36 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  39.46 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  38.04 
 
 		 194 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  38.71 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  37.22 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  36.17 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  38.25 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  35.2 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  37.16 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  35.52 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  35.56 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  34.44 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  36.31 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  33.52 
 
 		 181 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  35.14 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  32.07 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  31.52 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  38.21 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  32.86 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  32.34 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  32.34 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>