40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4630 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 		 72 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  58.33 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  63.33 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  63.33 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.65 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  52.94 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  43.06 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  46.77 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  45.45 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  44.44 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  55.1 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  48.98 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.81 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  60.98 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  46.77 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  46.77 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  50.77 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  67.74 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  40.28 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  37.1 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  38.81 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  45 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.5 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  51.22 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.15 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  56.41 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.15 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  41.38 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  42.03 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  46.15 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  64.52 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  42.11 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.15 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  45 
 
 		 90 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  41.1 
 
 		 76 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  41.1 
 
 		 76 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>