More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2615 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2615  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 229 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  88.44 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2283  two component transcriptional regulator, winged helix family  93.89 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2065  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 221 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0454664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1039  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.16 
 
 		 222 aa  285  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  51.18 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.55 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  52.61 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  51.18 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  54.03 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  50.71 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  49.34 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  51.18 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 223 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 257 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  52.61 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  48.03 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  51.18 
 
 		 221 aa  218  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 225 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.71 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  50.24 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  50.24 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  49.76 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.76 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  48.58 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.11 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.34 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1388  transcriptional regulatory protein PhoP  47.53 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0630  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000549408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5099  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.620422  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.89 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  45.49 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  45.97 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  44.25 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3431  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.866455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  46.08 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  43.56 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 221 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  45.09 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  43.11 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.89 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3779  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  42.67 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  46.48 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.85 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  45.07 
 
 		 219 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0241  two component transcriptional regulator  46.01 
 
 		 220 aa  178  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.07 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  45.07 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  45.07 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  45.07 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  41.41 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  42.67 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>