More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1964 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  93.96 
 
 		 513 aa  956    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  100 
 
 		 513 aa  1013    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  59 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 528 aa  440  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  47.36 
 
 		 515 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  44.8 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.28 
 
 		 514 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.6 
 
 		 517 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  45.07 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.08 
 
 		 514 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.87 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.08 
 
 		 514 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  44.6 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  43.98 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  46.28 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.28 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.36 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.45 
 
 		 495 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  43.66 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.55 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  44.6 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.83 
 
 		 507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  44.36 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.16 
 
 		 503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  45.6 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.76 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.83 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  42.74 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.57 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.05 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.63 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 		 519 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  43.55 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  43.29 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  43.96 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.75 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  42.41 
 
 		 510 aa  402  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.18 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  43.29 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  44.94 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 510 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.8 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  45.25 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 523 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  43.57 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  45.42 
 
 		 502 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  42.69 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  42.38 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.47 
 
 		 522 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  43.29 
 
 		 495 aa  399  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.18 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.02 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 		 520 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.18 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  42.45 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  45.4 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  43.75 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.09 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  43.46 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  42.45 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.63 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.57 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.87 
 
 		 514 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  45.45 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.42 
 
 		 513 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.16 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.48 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 498 aa  392  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 506 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  42.28 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  43.41 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.77 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  42.94 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  44.07 
 
 		 502 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.33 
 
 		 492 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  43.87 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  43.99 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  41.95 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  41.97 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  42.83 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.82 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  40.96 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  43.41 
 
 		 505 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>