More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1206 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  92.73 
 
 
275 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  83.27 
 
 
275 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  84 
 
 
274 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  70.7 
 
 
275 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  70.96 
 
 
276 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  70.96 
 
 
276 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  70.22 
 
 
278 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  67.51 
 
 
288 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  64.75 
 
 
296 aa  355  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  64.03 
 
 
291 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  66.06 
 
 
283 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  62.77 
 
 
276 aa  347  1e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  65.33 
 
 
285 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  65.11 
 
 
296 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  62.09 
 
 
286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  64.86 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  63.31 
 
 
280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  63.18 
 
 
287 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  62.09 
 
 
287 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  59.21 
 
 
286 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  62.72 
 
 
280 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  63.44 
 
 
282 aa  332  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  62.45 
 
 
287 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  60.65 
 
 
287 aa  332  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  57.4 
 
 
287 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  61.96 
 
 
288 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  63.14 
 
 
281 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  60.65 
 
 
278 aa  321  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  59.71 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  62.04 
 
 
297 aa  318  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  59.14 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  58.78 
 
 
278 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  61.85 
 
 
273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  60.07 
 
 
288 aa  299  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  58.15 
 
 
276 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  57.41 
 
 
271 aa  291  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  57.46 
 
 
275 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  56.2 
 
 
288 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  56.62 
 
 
272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  51.41 
 
 
289 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  41.2 
 
 
286 aa  202  6e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  40.47 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
277 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  41.96 
 
 
257 aa  175  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  43.23 
 
 
271 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  37.12 
 
 
276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
293 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  37.63 
 
 
299 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.18 
 
 
284 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
276 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 
294 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
268 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.92 
 
 
297 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
267 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  35.46 
 
 
290 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 
262 aa  160  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 
285 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 
285 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  36.3 
 
 
290 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39.34 
 
 
275 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  37.37 
 
 
292 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
293 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  38.08 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 
272 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.4 
 
 
267 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 
267 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 
268 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 
264 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 
265 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
268 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 
271 aa  157  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
268 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 
272 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
272 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  38.76 
 
 
268 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
272 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
272 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  36.78 
 
 
269 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
268 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  37.84 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  35.88 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
288 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
296 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0095  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 
273 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.12943  normal  0.356513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0096  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 
273 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>