36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2536 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  35.43 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4883  hypothetical protein  40.71 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85807  normal  0.0116813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2299  hypothetical protein  36.51 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  28.57 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  39.53 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  30.48 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  32.86 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  35.71 
 
 		 339 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4650  hypothetical protein  27.54 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3742  hypothetical protein  26.96 
 
 		 134 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  35.56 
 
 		 123 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  37.65 
 
 		 315 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  37.7 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  35.24 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  32.26 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  34.29 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  27.88 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.08 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  31.94 
 
 		 307 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  34.09 
 
 		 111 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  35.71 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  35.71 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  31.94 
 
 		 100 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  34.12 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  29.73 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  32.08 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  42.86 
 
 		 877 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  34.72 
 
 		 334 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  35.19 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  33.8 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  32.35 
 
 		 351 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  33.8 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  33.8 
 
 		 244 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>