67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1948 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  96.23 
 
 
504 aa  947    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  70.02 
 
 
511 aa  699    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  70.02 
 
 
513 aa  699    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  84.33 
 
 
526 aa  855    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  77.34 
 
 
504 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  70.28 
 
 
514 aa  695    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  100 
 
 
503 aa  1009    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  64.36 
 
 
511 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  62.35 
 
 
500 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  60.32 
 
 
500 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  59.92 
 
 
499 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  60.33 
 
 
499 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  59.07 
 
 
498 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  60.91 
 
 
516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  60.64 
 
 
507 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  62.55 
 
 
520 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  60.16 
 
 
506 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  60.97 
 
 
510 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  59.16 
 
 
504 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  59.96 
 
 
498 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  58.63 
 
 
502 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  58.28 
 
 
490 aa  532  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  57.83 
 
 
498 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  55.81 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  54.18 
 
 
492 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  29.15 
 
 
537 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  25.31 
 
 
655 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.47 
 
 
250 aa  60.1  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.71 
 
 
628 aa  54.3  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  26.36 
 
 
744 aa  54.3  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.54 
 
 
580 aa  53.9  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  26.86 
 
 
595 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  28.31 
 
 
524 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  25.43 
 
 
659 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  31.11 
 
 
645 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  29.61 
 
 
608 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  29.61 
 
 
608 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  29.81 
 
 
582 aa  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  29.32 
 
 
574 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  31.71 
 
 
550 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  29.05 
 
 
611 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  27.48 
 
 
360 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  21.35 
 
 
560 aa  47  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  27.35 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  26.67 
 
 
581 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  27.37 
 
 
608 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  36.11 
 
 
579 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  29.41 
 
 
531 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  28.67 
 
 
554 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  28.67 
 
 
554 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  28.03 
 
 
570 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  27.35 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  27.37 
 
 
605 aa  44.3  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  27.74 
 
 
427 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.81 
 
 
508 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  25.48 
 
 
581 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  25.4 
 
 
1368 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.4 
 
 
1329 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  25.4 
 
 
1342 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  25.4 
 
 
1342 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  26.48 
 
 
600 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  25.4 
 
 
1310 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  25.4 
 
 
1369 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  25.4 
 
 
1329 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  25.4 
 
 
1329 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  25.4 
 
 
1342 aa  43.5  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  26.72 
 
 
600 aa  43.1  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.901274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>