246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0024 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  96.81 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  82.8 
 
 		 188 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  80.21 
 
 		 186 aa  313  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  77.42 
 
 		 189 aa  301  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  72.73 
 
 		 190 aa  286  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  73.26 
 
 		 190 aa  281  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  73.26 
 
 		 190 aa  281  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  70.43 
 
 		 189 aa  279  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  65.95 
 
 		 188 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  66.14 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  66.14 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  66.67 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  66.3 
 
 		 192 aa  261  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  65.78 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  66.48 
 
 		 188 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  65.78 
 
 		 187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  67.42 
 
 		 188 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  65.17 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  64.09 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  67.72 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  63.33 
 
 		 190 aa  244  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  64.52 
 
 		 187 aa  243  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  64.55 
 
 		 187 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  61.29 
 
 		 187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  63.64 
 
 		 187 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  61.29 
 
 		 187 aa  238  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  61.29 
 
 		 186 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  61.29 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  61.29 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  58.85 
 
 		 190 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  59.14 
 
 		 183 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  62.16 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  63.44 
 
 		 186 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  61.83 
 
 		 186 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  55.03 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  54.79 
 
 		 189 aa  205  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  53.68 
 
 		 187 aa  204  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  59.36 
 
 		 185 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  55.73 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  53.8 
 
 		 191 aa  193  9e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  54.26 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  50.79 
 
 		 206 aa  189  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  47.89 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  46.77 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  43.68 
 
 		 254 aa  167  7e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  51.6 
 
 		 309 aa  165  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  45.74 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  42.42 
 
 		 326 aa  160  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.55 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.78 
 
 		 198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  41.67 
 
 		 242 aa  144  6e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  42.25 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  42.35 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.97 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  34.17 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  36.11 
 
 		 299 aa  111  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.79 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.24 
 
 		 299 aa  97.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  28.34 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  26.88 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.81 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.55 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.25 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  46.77 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  44.26 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  38.37 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  43.55 
 
 		 75 aa  62  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  46.97 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  46.77 
 
 		 72 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.79 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  39.47 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 72 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  44.29 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.62 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.1 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  39.47 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  45.76 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.38 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  42.62 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1004  NifU family protein  43.33 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0012863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  40.68 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.71 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  44.07 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  44.07 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  39.66 
 
 		 76 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 73 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  44.07 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1483  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.54 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  40.68 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  44.07 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  37.5 
 
 		 88 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>