180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4449 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 91 aa  189  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  83.52 
 
 		 94 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  67.42 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  67.42 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  66.29 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  62.07 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  50 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.54 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.48 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.48 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.48 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  51.14 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  53.75 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.94 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  49.45 
 
 		 95 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.89 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.82 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  50 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.19 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.83 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  48.89 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  49.4 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.43 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.44 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.25 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.15 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.25 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.78 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.45 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.44 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.5 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.06 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.18 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  41.33 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  37.93 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.71 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  41.1 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  44.05 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  44.05 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.29 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.53 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  38.55 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  37.65 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  37.65 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  42.7 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.33 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.27 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.75 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.74 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.04 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  42.67 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  41.18 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.06 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0885  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  42.35 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.77 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.57 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  41.33 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  30.43 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.33 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.48 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.04 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  40.28 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.29 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  38.16 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  35.11 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  45.61 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1368  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  29.35 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.21 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.14 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  30 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  32.14 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  32.14 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.14 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  30 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  32.14 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.33 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  32.14 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  30 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  32.14 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  30 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>