More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3726 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  64 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  65 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  65 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4234  hypothetical protein  64 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  58.73 
 
 		 199 aa  208  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0594  lysine exporter protein LysE/YggA  59.2 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3541  hypothetical protein  57.45 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000708449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0361  hypothetical protein  55.03 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  41.79 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  32.11 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  32.11 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  32.63 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  32.11 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  32.11 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  32.11 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  33.16 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  32.81 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  32.11 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.57 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.27 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.07 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.83 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.47 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.49 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.87 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.63 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  34.41 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  32.6 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  34.41 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  31.12 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  33.88 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  25.93 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  32.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  32.8 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  30.77 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  32.8 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  30.53 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  24.19 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  27 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  31.55 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2325  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  25.27 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.95 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  29.61 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  26.26 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  22.58 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  22.58 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.86 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  24.34 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  22.58 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  22.58 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  22.58 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  30.26 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2973  neutral amino-acid efflux protein  28.74 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2839  neutral amino-acid efflux protein  28.74 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2861  neutral amino-acid efflux protein  28.74 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.224539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>