31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3662 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 593 aa  1212    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  48.85 
 
 		 372 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 334 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  26.14 
 
 		 264 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  25.78 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  27.5 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 253 aa  63.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  26.71 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  24.86 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  23.16 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  28.57 
 
 		 260 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 260 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_4167  predicted protein  26.24 
 
 		 248 aa  55.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.512731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  30.07 
 
 		 566 aa  53.9  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  27.17 
 
 		 260 aa  53.9  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  29.56 
 
 		 291 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  28.86 
 
 		 883 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  25 
 
 		 346 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  26.55 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 467 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 1321 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 346 aa  47.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  29.91 
 
 		 475 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  23.6 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 320 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  23.93 
 
 		 409 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  26.95 
 
 		 286 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  24.7 
 
 		 260 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>