More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2188 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2188  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 347 aa  708    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.357964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4889  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  77.03 
 
 		 347 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2135  zinc-binding alcohol dehydrogenase  77.23 
 
 		 344 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  63.42 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63.42 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  63.72 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  60.7 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  62.24 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  60.12 
 
 		 334 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.91 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.77 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  55.98 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.89 
 
 		 335 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2927  alcohol dehydrogenase  60.42 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.84 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 		 344 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.4 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.19 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  44.54 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  46.65 
 
 		 342 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  48.12 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  45.11 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  45.8 
 
 		 346 aa  288  9e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0475  putative oxidoreductase  47.54 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.162605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  46.76 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.78 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.51 
 
 		 345 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  44.61 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2704  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.48 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.31 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.71 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2718  alcohol dehydrogenase  45 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00325052  normal  0.0915296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2673  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0563  alcohol dehydrogenase  45 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.0336788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.66 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.55 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  46.47 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.08 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 		 339 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  44.99 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3537  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.74 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1102  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0826967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3192  alcohol dehydrogenase  49.12 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.9 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.47 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.6 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3180  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 		 342 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.97 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.97 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.88 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.68 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  43.68 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  43.68 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  43.9 
 
 		 345 aa  275  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.9 
 
 		 345 aa  275  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  43.68 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.9 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0381  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 		 340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  43.6 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  43.6 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  45.72 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2265  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.83 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.209407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.25 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.6 
 
 		 345 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.19 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.6 
 
 		 345 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06817  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_7G04530)  44.86 
 
 		 353 aa  272  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.369571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2249  alcohol dehydrogenase  43.27 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4094  alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 		 337 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0931  oxidoreductase, zinc-binding  46.8 
 
 		 347 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.94 
 
 		 340 aa  269  5e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1097  alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3611  putative NADP-dependent oxidoreductase  46.92 
 
 		 340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.0277118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.1 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2291  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.64 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.312969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3068  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.36 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281772  normal  0.0896091 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3474  alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3174  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.58 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1786  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.94 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2201  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.19 
 
 		 338 aa  265  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  0.73824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.3 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.53 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.77 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2983  hypothetical protein  44.71 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  44.06 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  44.06 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.06 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2519  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.9 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.74525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3707  alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>